На третьем этапе осуществляется проектирование нововведения путем формализации идеи (разработка проекта или программы), которую осуществляет творческая группа. Прежде всего, анализируется состояние функционирования учебного заведения на основе проведенной диагностики, определяется будущая перспектива, очерчивается стратегия достижения цели. Если школа старается провести изменения одновременно на нескольких направлениях, скажем, в воспитательной системе, содержании, учебных технологиях, управленческих подходах, тогда каждая группа выстраивает собственную стратегию достижения цели. Результатом этапа является подготовленный проект нововведения, где должны быть отражены цель, задача, основные мероприятия по реализации новой идеи, привлеченные ресурсы, критерии изменений и методика выявления эффективности инновационного процесса.

На четвертом этапе происходит освоение (апробация) новой педагогической идеи. Поэтому важным для руководителя школы является учет «человеческого фактора» (мотивация, стрессы, функциональная неопределенность, своевременная осведомленность, не контролирование ситуаций и т.п.) в инновационном процессе и создании комфортных условий для работы всех субъектов инновационной деятельности.

Целью пятого этапа являются определения стратегии управления и обеспечение подготовки субъектов инновационного поиска к работе в новых условиях. На этом этапе важное, значение приобретает роль консультанта (научного руководителя) как одного из руководителей инновационной педагогической программы. Речь идет, прежде всего, о выборе стиля управления, умение презентовать идею, оценивать и контролировать промежуточные результаты, делегировать полномочие, мотивировать к сотрудничеству, налаживать внешнюю коммуникацию и т.п. Эффективность нововведений в значительной мере зависит от готовности участников к инновационной деятельности. Поэтому особое значение приобретает процесс обучения педагогами-исследователями, во время которого происходит освоение механизмов поисково-исследовательской работы и инновационных технологий.